Ishiyamadera est la 13e étape du pèlerinage de Saigoku Kannon, qui compte 33 temples bouddhistes. Sur son vaste terrain se dresse le monument naturel de wollastonite, dont est tiré le nom « Ishiyama » (« montagne de pierre »). Le temple abrite un grand nombre de trésors nationaux et de biens culturels importants, notamment une pagode à deux étages ainsi qu’une variété de textes religieux, de statues bouddhistes et de parchemins.
On raconte que « Le Dit du Genji », l’un des textes les plus célèbres du Japon, a été conçu par son auteure Murasaki Shikibu alors qu’elle contemplait la lune des moissons se reflétant dans le lac Biwa lors d’un séjour au temple Ishiyamadera. Ce paysage, devenu emblématique de la puissance mystérieuse du lac Biwa et de l’eau elle-même, est désormais un élément essentiel de la culture de l’eau et du mode de vie local.